中国水产科学研究院东海水产研究所海南琼海试验基地位于海南省琼海市长坡镇椰林村。海南琼海试验基地处于热带季风及海洋湿润气候区，年均气温24℃，阳光年均辐射量119千卡/平方米，是“天然大温室”，优越的海洋气候资源为发展水产南繁提供了得天独厚的自然条件。海南试验基地设有综合繁育、种苗培育、亲本培育和可控环境等4个试验车间，配备水质分析、生态生理、病害检测及精密仪器分析实验室，是一集水产科学研究、技术示范推广和人才培养为一体的水产品苗种繁育试验基地。基地周边各种生物饵料及配合饲料配套齐全。

琼海基地利用海南得天独厚的自然资源优势，重点围绕青蟹、篮子鱼、锈斑蟳、海马等品种，综合应用现代育种技术，筛选开发优异新种质，选育优良新品种，示范推广新品种（系）和繁育养殖等配套技术，支撑水产种业振兴行动。面向海南海水养殖产业发展，开展绿色养殖、精深加工、养殖尾水处理等技术与装备开发，服务区域渔业高质量发展。